Народився 16 жовтня 1965 року в с. Свесса Ямпільського району Сумської області. Після закінчення у 1989 році педіатричного факультету Харківського медичного інституту працював ургентним травматологом Сумської обласної дитячої клінічної лікарні.
У СумДУ працює з 2005 року.
Кандидат медичних наук з 2005 року. Дисертацію «Юнацький епіфізеоліз головки стегнової кістки. Питання етиології, патогенезу, діагностики та лікування» захистив у спеціалізованій вченій раді Інституту патології хребта та суглобів імені проф. М.І. Ситенка. Науковий керівник –д.мед.н., професор Шевченко С. Д.
Доктор медичних наук з 2013 року. Дисертацію «Клініко-організаційні засади лікування постраждалих дитячого віку з поліорганними та полісистемними пошкодженнями на догоспітальному етапі надання медичної допомоги» захистив у спеціалізованій вченій раді Донецького національного медичного університету імені М. Горького МОЗ України. Науковий консультант – д.мед.н., професор Гур’єв С. О.
У 2018 році отримав вчене звання професора. Завідувач кафедри екстреної медичної допомоги та медицини катастроф з 2020 року.
Професор Шкатула Ю. В. є автором 120 наукових праць, 4 навчальних посібників, монографії і 5 патентів.